Sí que sigue actuando. Para los que cometieron esos actos que hoy serían constitutivos de delito, ésa era la legalidad vigente.
Y aunque se pudiera hacer la ficción de que todo lo promulgado entre 1936 y 1975 es nulo de pleno derecho (que, insisto, es algo muy fuerte), quedarían exclúidos de responsabilidad criminal por haber actuado con error (artículo 14 del Código Penal): Difícilmente puedes saber que algo es delito cuando el Estado al que perteneces, y en su caso te ha de juzgar, te dice que está permitido.
Si una dictadura como lo que es impone "legalmente" el estado de excepción, por lo que se suspenden todos los derechos del ciudadano, o sitúa a una serie de ciudadanos (en este caso homosexuales, marginales, o rojos) permanentemente en "cuarentena" jurídica, ¿también actúa dentro del principio de legalidad? No lo creo. Un estado de excepción, por mucho que se haga legal, sigue siendo fuerza bruta, lo entiendan los subalternos al obedecer órdenes o no.